1#01 L'oeil du témoin (Blink)
Le corps d'une femme qui a disparu mène Mac sur la piste d’un serial killer qui emprisonne ses victimes. Les agents doivent assembler les pièces du puzzle et ils sont aidés par une femme qui a survécu mais qui ne peut communiquer que par des clignements d’œil.


1#02 Les créatures de la nuit (Creatures of the night)
Stella est chargée de retrouver un attaquant qui a violée une femme dans Central Park, mais sa mission est ralentie par le fait que la victime ne se souvienne de rien. De plus, en dépit de l’abondance des preuves présentes sur les lieux du crime, les agents ne parviennent pas à relier un suspect au viol et Stella se sent frustrée. Pendant ce temps, Mac et Aiden poursuivent un rat qui a avalé la balle d’un crime impliquant un trafiquant de drogue.


1#03 1987 (American dreamers)
Quand une touriste découvre un squelette dans un autobus à Time Square, les enquêteurs doivent déterminer s’il s’agit d’une blague ou si une personne a été assassinée. Après avoir examiné les restes de manière approfondie, le docteur Hawkes découvre que la victime était probablement un adolescent caucasien qui est mort d'un coup porté à la tête il y a plus de dix ans. Leurs recherches les mènent alors à un garçon qui a disparu depuis 1987.


1#04 Poisson mortel (Grand master)
Mac et Aiden enquêtent sur le meurtre d'un artiste à l'avenir prometteur spécialisé dans le hip-hop qui a été poignardé peu de temps après avoir remporté un concours réunissant les meilleurs D.J. et signé un contrat avec un nouveau label. Par ailleurs, Stella et Danny tentent d'en savoir plus sur la mort d'une créatrice de mode dont le corps a été retrouvé dans sa piscine.


1#05 Le tunnel de l'enfer (A man a mile)
Mac et Danny enquêtent sur un ouvrier qui est mort pendant une explosion souterraine. Les agents interrogent les "Sandhogs," un groupe de travailleurs qui construit les tunnels de la ville. Quand l’autopsie leur révèle que Pete est mort d’une crise d’asthme et qu’ils trouvent un inhalateur vide, Mac et Danny réalisent la victime a été laissée intentionnellement dans le souterrain. Pendant ce temps, Stella et Aiden enquêtent sur la mort d’une jeune fille de 16 ans qui a été étranglée et dont le corps a été retrouvé flottant dans une crique.


1#06 Membre à part (Outside man)
Afin de les tester, Mac confie à Danny et Aiden une enquête assez difficile : un homicide multiple dans lequel les employés d'un restaurant de Brooklyn ont été retrouvés criblés de balles et avec des sacs en plastique sur la tête. Les indices les laissent penser que le meurtrier se trouvait à l’intérieur mais ils n’ont aucun suspect. Pendant ce temps, grâce à une jambe amputée retrouvée sur les docks, Mac et Stella remontent jusqu’à un homme mort dans son lit.


1#07 Hold-up (Rain)
Un cambriolage est commis dans une banque de Chinatown et les choses tournent mal. Une explosion tue un vigil et deux des trois voleurs. Lorsque les enquêteurs interrogent Joanne Cho, une employée de l’établissement, celle-ci finit par avouer que sa fille a été enlevée et qu’elle a reçu une note lui disant qu’elle devait aider les cambrioleurs si elle voulait que son bébé reste en vie. Alors qu’ils examinent les preuves sous toutes les coutures, les agents apprennent qu’une rançon a été réclamée.


1#08 La malédiction du sang (Three generations are enough)
Danny et Mac enquêtent sur une sombre affaire. Une mallette appartenant à Luke Sutton, un agent de change, est retrouvée abandonnée à la bourse de New York. Elle contient une lettre signée de sa main et marquée de son sang. Le disparu est bientôt retrouvé, carbonisé au volant de sa voiture. Par ailleurs, Stella et Flack tentent d'élucider la mort d'une jeune femme enceinte retrouvée dans un jardin derrière une église.


1#09 Meurtre à Central Park (Officer blue)
Quand un officier de la police monté de New York se fait tirer dessus et que la balle finit sa course dans le cou de son cheval, Mac doit prendre une décision : retirer le projectile, ce qui tuerait l’animal, ou bien le sauver et perdre une preuve capitale. Pendant ce temps, Aiden travaille sur le cas d’un jeune homme retrouvé mort et gravement brûlé dans une ruelle du Queens.


1#10 Promenade nocturne (Night, mother)
Jason, un jeune qui joue au basket dans la rue, découvre le cadavre de Rachel Camden. Agenouillée près d'elle, une autre femme ensanglantée, Ophelia Dichiara, lui masse le coeur, les mains plongées dans sa poitrine ouverte. Mac et Stella comprennent qu'Ophelia est somnambule. Elle a refait à Rachel les gestes qu'elle a vu faire sur son petit garçon des années auparavant. Pendant ce temps-là, Aiden et Danny ont affaire à un gang de pickpockets dont l'un des membres a été battu à mort.


1#11 Terminus (Tri-borough)
Stella et Mac enquêtent sur la mort d'un homme retrouvé électrocuté sur les rails du métro. Par ailleurs, Danny s'intéresse au meurtre du propriétaire d'une galerie et Aiden et Flack à celui d'un ouvrier.


1#12 Dernière course (Recycling)
Des propriétaires de chiens de compétitions deviennent les principaux suspects de Mac dans une affaire de meurtre. Pendant ce temps, Stella et Danny enquêtent sur la mort d’un coursier qui a été poignardé dans une rue de Manhattan à une heure de grande influence. Les deux enquêtent révèlent que les victimes n'étaient pas des personnes particulièrement appréciées par leurs collègues.


1#13 Du sang sur la neige (Tanglewood)
Stella et Mack enquêtent sur la mort de Paul Montenassi, un jeune homme assassiné à coups de batte de base-ball et dont le corps a été retrouvé dans la neige. Celui-ci portait un tatouage affirmant qu'il appartenait à un gang. Danny et Aiden cherchent à comprendre les raisons de la mort suspecte de Marta Santo dans un accident de voiture. Ils découvrent que la victime était une prostituée qui travaillait dans un salon de massage particulier.


1#14 Mise en boîte (Blood, sweat & tears)
Quand un jeune contorsionniste de 16 ans est retrouvé mort plié dans une petite boîte enterré sur une plage de Coney Island, Mac et Stella interrogent la famille de la victime et leurs rivaux - les trapézistes qui se battent pour être les stars du cirque. Parallèlement, Danny et Flack retrouvent le corps d'une femme dans une buanderie.


1#15 Jusqu'à ce que la mort nous sépare (Til death do we part)
Mac et Danny enquêtent sur la mort mystérieuse d’une jeune femme qui s’est effondrée juste avant son mariage. Bien qu’impatient d’effectuer une autopsie, le docteur Hawkes est contraint de patienter car le père de la victime a demandé à ce que le corps soit d’abord béni par un rabbin. Pendant ce temps, Stella, Aiden et Flack sont appelés à la rescousse quand le corps sans mains d’un ancien escroc est découvert dans un monastère de Staten Island qui serait soi disant hanté par des moines qui y auraient été assassinés dans le passé.


1#16 Jeux très interdits (Hush)
Mac et Stella sont appelés sur un scène de crime où ils découvrent la moitié inférieure d’un corps enterré sous un container sur les docks de Staten Island. L'équipe doit faire cesser le travail aux ouvriers se trouvant sur place afin de retrouver l’autre moitié du corps parmi les containers et, fait très rare, le docteur Hawkes sort de sa morgue pour aider ses collègues. Pendant ce temps, Danny et Aiden enquêtent sur la mort d’une femme trouvée nue sur une autoroute du Queens.


1#17 Lourde chute (The fall)
Le commerçant d'une boutique de vins dans un quartier huppé de la ville a été abattu par un gang de trois jeunes hispaniques. Sur place, Mac et Stella s'attellent à récolter les indices. La chance leur sourit lorsqu'au milieu d'une mare de sang ils découvrent un briquet. Sur l'objet : une série d'empreintes. Pendant ce temps, Danny et Aiden enquêtent sur la chute mortelle d'un richissime producteur de cinéma.


1#18 Affaires internes (The dove commission)
L’auteur d'un rapport controversé sur la corruption au sein de la police de New York trouve la mort avant que ses résultats n’aient été publiés. Mac et Stella doivent alors trouver le tueur et ils en arrivent vite à la conclusion qu’il s’agit d’un policier. Pendant ce temps, Danny et Aiden enquêtent sur le meurtre d'un chauffeur de taxi.


1#19 Linge sale (Crime and misdemeanor)
Quand le corps d'une jeune femme est découvert dans un service de blanchisserie, les draps dans lesquels elle est enveloppée conduisent Mac et Stella dans un hôtel huppé de New York qui accueille des diplomates du monde entier quand les Nations Unies se réunissent pour de sessions spéciales. Pendant ce temps, Danny et Aiden enquêtent sur la mort d'un homme sans domicile fixe qui a été retrouvé habillé comme une statue humaine. Pour tout le monde il s’agit d’une farce mais Danny décide de fouiller en profondeur et son refus d’arrêter l’enquête le met en désaccord avec Mac.


1#21 Erreur sur la cible (On the job)
L'équipe de Mac investit l'appartement d'un dealer de drogue. Celui-ci a été abattu dans son salon. En inspectant les lieux, Danny se heurte à un inconnu surgi d'un placard. Le policier le prend alors en chasse et la poursuite s'achève dans une station de métro. Croyant tirer sur le suspect, il abat en réalité un officier en civil. Au même moment, Stella enquête sur la mort d'une baby-sitter.


1#22 Balles de match (The closer)
Toute l'équipe enquête sur le meurtre d'un supporter de l'équipe de baseball de Boston retrouvé mort dans son véhicule. Par ailleurs, un camion heurte une jeune femme qui courait, pieds nus et en déshabillé, sur la route au petit matin. Les enquêteurs cherchent à savoir ce qu'elle faisait là et d'où elle venait.


1#23 Expert et témoin (What you see Is what you see)
Alors que Mac prend son petit-déjeuner dans son café habituel, un des clients ouvre le feu. Un homme est tué et la serveuse gravement blessée. Unique témoin du meurtre, Mac doit faire un choix : se lancer à la poursuite du témoin ou secourir la jeune femme. Cette affaire est en fait liée à de faux-monnayeurs que Stella et Mac tentent d'arrêter.